La misión del SEC se define a partir de una declaración duradera de propósitos, que definen la esencia y naturaleza de ser y a lo que se dedicará; por lo que el SEC: Es una organización Político Sindical que representa los legítimos y auténticos intereses de la clase trabajadora y del sector educativo en particular, nos caracterizamos por ser un sindicato con un potencial de membresía que viene elevando la conciencia social alcanzando conquistas de trascendencia para la sociedad costarricense.
 

La misión del Sindicato de trabajadores de la Educación Costarricense, está dirigida a la defensa de la Educación Pública de calidad y de la clase trabajadora, estamos inmersos y a la vanguardia de los procesos de transformación social en Costa Rica.Somos promotores de la democracia participativa y de género, la unidad, solidaridad, libertad, crítica y autocrítica, que surge del análisis y de la reflexión. Para así, convertirse y arraigarse como una Organización prospectiva-reivindicativa y propositiva con autonomía en su accionar en beneficio del bien común.Nuestra práctica política sindical tiene un carácter de compromiso clasista, honesto, transparente y de calidad lo que nos exige ser eficientes y eficaces en los retos que se nos presentan en el actual momento histórico.